Dans un Japon futuriste régi par l’Internet, le major Motoko Kusunagi, une femme cyborg ultra-perfectionnée, est hantée par des interrogations ontologiques. Elle appartient, malgré elle, à une cyber-police musclée dotée…

James Vega, capitaine de l’Alliance Marine, doit former un groupe d’élite spéciale pour affronter un mystérieux extraterrestre, connu sous le nom de « The Collectors ».